En cette fin de 19e siècle, le professeur Aronnax, son fidèle ami Conseil et l'intrépide Ned Land, sont toujours prisonniers du Nautilus. Le capitaine Nemo, homme énigmatique, refuse de les laisser partir, de peur qu'ils n'éventent le secret de son redoutable sous-marin. Bon gré, mal gré, les trois compères parcourent les océans à bord de l'incroyable machine. Ils iront là où aucun homme ne s'est encore aventuré, des plus sombres abysses au cœur des glaces de l'Antarctique. Survivront-ils à l'aventure ? Arriveront-ils à se tirer des griffes de leur geôlier, qui bien qu'aimable, n'en reste pas moins un homme torturé par son passé ?