Le pays Inca est à feu et à sang depuis la mort de l’empereur. Ses fils se disputent le trône ; le peuple est décimé par l’épidémie de variole apportée par ces conquistadors venus d’Europe qui cherchent à conquérir toujours plus de territoire. Revenu dans le village qui l’a vu grandir pour en savoir plus sur ses origines, Amaru tente vaille que vaille de sauver Nuna, grièvement blessée, en l’amenant chez son ami Sayri. Il fait également appel aux connaissances du vieil homme pour déchiffrer le message inscrit sur les langes dans lequel il fut trouvé nourrisson : il s’agirait d’une obscure prophétie dont Amaru le « Fils du Soleil » pourrait bien être la clé...