1848, dans l'océan Pacifique. L'équipage du Princess commandé par le capitaine Horatio Dobbs est atteint par une maladie tropicale. Sur une île inconnue, un médecin indigène les sauve de la mort.

De nos jours, dans les îles de Micronésie. Un laboratoire sous-marin, financé dans le plus grand secret par le gouvernement américain, disparaît. Il effectuait des recherches sur la «méduse bleue », une espèce rare.

Au même moment, au large des Bermudes, une bathysphère est attaquée et immobilisée à plus de cinq cent mètres de profondeur…

Kurt Austin engage l'équipage de la Numa car il suspecte un lien avec une puissante organisation de criminels chinois, qui mène des expériences médicales et aurait découvert un nouveau virus. Austin et Joe Zavala vont devoir tenter le tout pour le tout pour sauver non seulement leurs vies mais celle de milliers de personnes…