Cyclope et Emma Frost, les nouveaux directeurs de lInstitut pour Jeunes Surdoués de Charles Xavier, reforment les X-Men et ont pour objectif de surprendre le monde entier. Tandis quun gène mutant vient dêtre identifié, des mouvements protestataires se multiplient pour que soit créé un traitement. Les X-Men vont alors affronter Ord puis assister au retour dun allié disparu et à lapparition dune redoutable ennemie.