Ryô Takatsuki est un lycéen de deuxième année. En faisant la rencontre de Hayato Shingû et de Takeshi Tomoe, deux nouveaux élèves, il se rend compte qu'il possède, tout comme eux, un ARMS. Tandis que les trois garçons sont la cible d'une mystérieuse organisation, nommée Egregori, Ryô devra apprendre à maîtriser son bras surnaturel...