Pendant qu’une moitié de Sakura a suivi Shigure et Hiyori, l’autre moitié, avec Ôgami et les autres, veut atteindre l’Éden. L’entrée de ce dernier se trouve être la dernière porte au dernier sous-sol du manoir Shibuya. Les portes sont nombreuses et nos héros rencontrent, derrière certaines des victimes de l’Éden : des enfants marqués d’une croix, les ratés des expériences génétiques de l’Éden, des jeunes filles zombies et le gardien de la dernière porte... Quand ils entrent enfin dans l’Éden, ils trouvent un bâtiment identique au palais de la Diète et une fresque représentant ce qui semble être les événements du 32 décembre... Les code:names et leurs sbires les y attendent de pied ferme...