Sur la station orbitale... Un homme se tient immobile, le poids de la solitude pesant de toutes ses forces sur ses épaules… Mais il est sous l’emprise de son ennemie jurée, le mage du commencement qui hante son esprit à l’aide de sa “résonance”. Il doit supporter une douleur inimaginable ! Tôta et ses amis se sont promis de sauver Negi mais parviendront-ils à vaincre le mage du commencement ?! Un combat titanesque s’amorce !

Nodoka miyazaki, negi springfield, yue ayase, rakan... Les personnages de Negima! font leur retour.