Shizuka est une jeune policière aussi intelligente que douée avec un revolver. Son prénom qui signifie "silence' en japonais et son habilité à manier les silencieux lui ont valu le surnom de "Silencer'. En stage dans la police de New York pendant deux ans, Shizuka est en mission de couverture en tant que prostituée pour neutraliser un chef de la pègre, ce qu'elle réussit brillamment.

De retour au Japon, elle est mise de côté par sa hiérarchie qui voit en elle un élément gênant. Elle est transférée au "Bureau de la sureté', un placard ou elle a pour coéquipier Iba, un homme bourru et sexiste qui a plein de contacts dans le milieu criminel. Leurs missions se limitent aux personnes âgées atteintes de démence et aux chats coincés dans les arbres.

Devant un tel ennui, Shizuka et Iba cherchent de vrais cas et ils se retrouvent à enquêter sur un cas de traite de jeunes filles par les nord-coréens qui les enlèvent et en font des esclaves sexuelles avant de les tuer. Les deux policiers parviennent à sauver un groupe de jeunes filles mais on apprend que Shizuka elle-même a un passé trouble avec cette dictature et que celui-ci semble la poursuivre encore aujourd'hui...