Né de père inconnu et orphelin de mère, très agressif dans ses rapports avec autrui et souvent à la frontière de la délinquance, James Choke est recruté par une organisation secrète du gouvernement britannique, CHERUB, qui utilise un corps de 280 agents de 10 à 17 ans pour mener à bien des missions dangereuses hors de portée des adultes. Au terme d'une formation très dure, et désormais doté d'une nouvelle identité, James Adams, le jeune garçon effectue sa première opération clandestine au sein d'une organisation écoterroriste, dont il contribue à faire échouer un projet d'attentat à l'anthrax...